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Resumen de investigación

El virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) es un retrovirus que infecta preferentemente a células del sistema inmune y provoca el síndrome de inmunodeficiencia adquirida (SIDA). Actualmente, el tratamiento de la infección por el VIH se basa en la utilización de inhibidores de enzimas del virus como la retrotranscriptasa (RT), la proteasa y la integrasa, además de dos fármacos que actúan bloqueando la entrada del VIH en la célula hospedadora. Las terapias combinadas que incluyen dos o tres inhibidores de la RT han demostrado una gran eficacia clínica. Sin embargo, la aparición de virus resistentes, la existencia de reacciones cruzadas entre distintos fármacos, además de sus efectos secundarios son factores que hipotecan su utilidad a largo plazo.
Nosotros estamos interesados en el estudio de dianas terapéuticas en el VIH, con un enfásis particular en la RT. Esta enzima es la responsable de la replicación del ARN que constituye el material genético del virus. Recientemente nuestros esfuerzos se han dirigido hacia la consecución de dos objetivos importantes: (1) entender el papel que juegan distintos aminoácidos en la especificidad de nucleótido y en la fidelidad de copia de la enzima; y (2) determinar cuáles son los mecanismos moleculares implicados en resistencia a inhibidores de la RT y cuál es la contribución de los distintos cambios de aminoácido en la adquisición de resistencia.
Además, los estudios de la especificidad de nucleótido de la RT pueden servirnos para desarrollar nuevas herramientas de utilidad en biología molecular. Por ejemplo, RTs más fieles y estables a temperaturas elevadas, con aplicaciones importantes en estudios de expresión génica. Finalmente, la extensión de estos análisis a otras actividades catalíticas de la RT (por ejemplo, ribonucleasa H), o al proceso de iniciación de la retrotranscripción puede abrir nuevas posibilidades en el diseño de estrategias terapéuticas para el tratamiento de la infección por el VIH.



Publicaciones

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Menéndez-Arias, L. (2002) Molecular basis of fidelity of DNA synthesis and nucleotide specificity of retroviral reverse transcriptases. Prog. Nucleic Acids Res. Mol. Biol. 71, 91-147
Menéndez-Arias, L. (2002) Targeting HIV: Antiretroviral therapy and development of drug resistance. Trends Pharmacol. Sci. 23, 381-388.
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Matamoros, T., Franco, S., Vázquez-Álvarez, B. M., Mas, A., Martínez, M. A., Menéndez-Arias, L. (2004) Molecular determinants of multi-nucleoside analogue resistance in HIV-1 reverse transcriptases containing a dipeptide insertion in the fingers subdomain – Effect of mutations D67N and T215Y on removal of thymidine nucleotide analogues from blocked DNA primers. J. Biol. Chem. 279, 24569-24577
Matamoros, T., Deval, J., Guerreiro, C., Mulard, L., Canard, B., Menéndez-Arias, L. (2005) Suppression of multidrug-resistant HIV-1 reverse transcriptase primer unblocking activity by alpha-phosphate-modified thymidine analogues. J. Mol. Biol. 349, 451-463.
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Version 1.4 (July 2009) of the software described in the article can be downloaded from:
http://www2.cbm.uam.es:8080/lmenendez/DR_SEQAN.zip
Menéndez-Arias, L., Matamoros, T., Cases-González, C.E. (2006) Insertions and deletions in HIV-1 reverse transcriptase: Consequences for drug resistance and viral fitness. Curr. Pharm. Des. 12, 1811-1825
Cases-González, C.E., Franco, S., Martínez, M.A., Menéndez-Arias, L. (2007) Mutational patterns associated with the 69 insertion complex in multidrug-resistant HIV-1 reverse transcriptase that confer increased excision activity and high-level resistance to zidovudine. J. Mol. Biol. 365, 298-309.
Villena, C., Prado, J.G., Puertas, M.C., Martínez, M.A., Clotet, B., Ruiz, L., Parkin, N.T., Menéndez-Arias, L., Martinez-Picado, J. (2007) Relative fitness and replication capacity of a multinucleoside analogue-resistant clinical human immunodeficiency virus type 1 isolate with a deletion of codon 69 in the reverse transcriptase coding region. J. Virol. 81, 4713-4721.
Olivares, I., Mulky, A., Boross, P.I., Tözsér, J., Kappes, J.C., López-Galíndez, C., Menéndez-Arias, L. (2007) HIV-1 protease dimer interface mutations that compensate for viral reverse transcriptase instability in infectious virions. J. Mol. Biol. 372, 369-381.
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Mendieta, J., Cases-González, C.E., Matamoros, T., Ramírez, G., Menéndez-Arias, L. (2008) A Mg2+-induced conformational switch rendering a competent DNA polymerase catalytic complex. Proteins: Struct. Funct. Bioinf. 71, 565-574.
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Menéndez-Arias, L. (2008) Mechanisms of resistance to nucleoside analogue inhibitors of HIV-1 reverse transcriptase. Virus Res. 134, 124-146.
Kisic, M., Mendieta, J., Puertas, M.C., Parera, M., Martínez, M.A., Martínez-Picado, J., Menéndez-Arias, L. (2008) Mechanistic basis of zidovudine hypersusceptibility and lamivudine resistance conferred by the deletion of codon 69 in the HIV-1 reverse transcriptase coding region. J. Mol. Biol., 382, 327-341
Garriga, C., Pérez-Elías, M.J., Delgado, R., Ruiz, L., Pérez-Álvarez, L., Pumarola, T., López-Lirola, A., González-García, J., Menéndez-Arias, L., on behalf of the Spanish Group for the Study of Antiretroviral Drug Resistance (2009) HIV-1 reverse transcriptase thumb subdomain polymorphisms associated with virological failure to nucleoside drug combinations. J. Antimicrob. Chemother. 64, 251-258
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Clotet, B., Menéndez-Arias, L., Schapiro, J. M., Kuritzkes, D., Burger, D., Telenti, A., Brun-Vezinet, F., Geretti, A. M., Boucher, C. A., Richman, D. D. (eds.) (2009) Guide to management of HIV drug resistance, antiretrovirals pharmacokinetics and viral hepatitis in HIV infected subjects, 9th Edition. Fundació de Lluita contra la SIDA, Barcelona.
Matamoros, T., Nevot, M., Martínez, M.A. y Menéndez-Arias, L. (2009) Thymidine analogue resistance suppression by V75I of HIV-1 reverse transcriptase: Effects of substituting Valine 75 on stavudine excision and discrimination. J. Biol. Chem. 284, 32792-32802.
Menéndez-Arias, L. (2009) Mutation rates and intrinsic fidelity of retroviral reverse transcriptases. Viruses 1, 1137-1165.
Menéndez-Arias, L. (2009) Molecular basis of human immunodeficiency virus drug resistance: An update. Antiviral Res. (on-line, doi:10.1016/j.antiviral.2009.07.006)

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Premios


Tesis doctorales

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Clara E. Cases González. 2004. “Análisis de la especificidad de nucleótido y fidelidad de copia de variantes de la retrotranscriptasa del virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1”. Universidad Autónoma de Madrid. Premio Extraordinario de Doctorado.
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Tania Matamoros Grande. 2008. "Determinantes moleculares implicados en la resistencia a análogos a timidina y en la fidelidad de copia de la retrotranscriptasa del virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1". Universidad Autónoma de Madrid. Premio Extraordinario de Doctorado.
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Patentes

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L. Menéndez Arias, T. Matamoros (2006). Fosforotioatos derivados de análogos a nucleósido para terapia antirretroviral. Ref.: PCT/ES2006/070042.
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C/Nicolás Cabrera 1 Campus de la Universidad Autónoma de Madrid.. 28049-Madrid .
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